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分析人类基因组
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基因组到底是什么
有多少读者听说过“基因组”
这个词呢?
我想,应该比听说过“基因”
的人要少一些吧。
基因组指的是生物体所有遗传物质的总和,大家把它理解成一整套的基因就可以了。
基因组(genome)这个词,是基因(gene)加上希腊语中表示“全部、完整”
(-ome)的词缀组成的合成词。
我以为,“研究对象+ome”
合成的词语,在自然科学的学科当中,也只有生物学有此创想。
这可以说是一种“网罗主义”
的思维方式。
与之相对的,我想应该就是物理学的“原教旨主义”
。
简而言之,在研究同一种自然现象时,物理学等学科崇尚普遍的理论或者原理,并追求建立模型。
生物学当然也会追求普遍的规律。
但对规律的追求都是暂时的,往往会追加许多例外情况,从整体、全面的角度去考虑。
换言之,物理学是从种种现象中排除多余的事物,摸索出普遍的原理。
而生物学则是在普遍的原理的基础上,发现多种多样的现象,在研究过程中不断将规律的范围扩大。
最近,人们对所有转录产物(transcript)的集合—转录组(DNA转录得到的所有RNA)、所有蛋白质(protein)的集合蛋白质组(翻译出的所有蛋白质)越来越关注。
而这些研究的源头,都来自试图研究所有遗传物质的基因组研究法。
因此,人们开始对各种生物开展名为“基因组计划”
(Ge)的研究尝试。
但准确地说,基因组计划其实是分析所有作为基因本体的染色体DNA的核酸序列,而并非分析所有的基因,也就是真正意义上的基因组。
基因组计划归根结底只是在为分析基因组分析做准备(一种极其重要的准备)。
在这一驱使下开启的基因组计划之一,正是“人类基因组计划”
。
人类基因组计划,是于1990年在美国的主导下启动的。
初始的预算是30亿美元,计划开展15年。
但随着过程中计划推进速度加快,大致的序列分析(被称作“测序草图”
)在2000年就完成了。
而在2003年,也就是沃森和克里克发现DNA双螺旋结构50周年之际,测序工作全部完成。
表观遗传突变
“人类基因组计划”
的目标就像刚才提到过的那样,是列举出人类所有染色体DNA的核酸序列,而最终目的则是分析基因组。
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