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第一 基因组病（第5页）

与核型分析相比，CMA有可能揭示结构重排断裂点周围的微小缺失或重复，从而更好地指导临床结局。

美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）和由美国国立卫生研究院专门资助的跨国个体化医疗数据中心项目（）共同发布了胚系DNA拷贝数解读和报告标准，该标准将V分为了五类：致病性、可能致病、临床意义不明确、可能良性、良性。

V分类的主要依据包括以下几个方面：第一，评估是否包含蛋白编码基因或者已知的重要功能元件；第二，评估是否已知或预测的单倍剂量不足三倍剂量敏感基因或区域重合，或与已知良性基因、区域重合；第三，评估V区域包含的蛋白编码基因数目（分为全部包含或部分包含）；第四，需要查询已发表文献、公共数据库或实验室内部数据库对V包含内容的详细评估，已经报道过的与本次观察到V片段或包含基因相似的病例的表型、遗传模式、家系共分离和病例—对照研究；第五，评估本次检测研究的病例在其家系中的遗传模式、表型和共分离情况。

（一）致病性V

多篇文献已明确其致病性，即使该V存在外显不全和表现度有差异也应判定为致病性。

该类别还包括以下情况：

1.一段缺失或重复与一个已报道的微缺失／微重复综合征致病区域在位置和大小上匹配；

2.缺失区域包含因单倍剂量不足敏感基因，重复区域包含三倍剂量敏感基因（剂量敏感分数3分）；

3.按V综合评分体系（vie.vcalc）得分≥0.99分。

（二）可能致病V

有较强证据表明其致病的可能性非常大，但目前的证据尚不足以完全确定其致病性，包括以下情况。

1.涉及已知单倍剂量不足敏感基因5’端（及其他编码序列）的缺失（在已知不存在其他转录起始位点的情况下）；

2.涉及已知单倍剂量不足敏感基因包括3’端在内的多个外显子的缺失；

3.涉及多篇病例报道的基因缺失或重复，表型一致且高度特异或者按V综合评分体系得分0.90~0.98分。

（三）可能良性V

有较强证据表明该V很可能与孟德尔遗传疾病不相关，但目前还没有达到“良性”

分类的充分证据。

该类变异包括：

1.普通人群中多次被观察到，但频率＜1%；

2.在病例组和对照组中无统计学差异；

3.按V综合评分体系得分-0.98~-0.90分。

（四）良性V

多篇文献已证实或权威数据库报道为良性变异，特别是良性特性已经非常明确或是常见的多态性片段，包括：

1.涉及的omAD数据库的频率≥1%；

2.按V综合评分体系得分≤-0.99分。

需要强调的是，对良性V的剂量效应要仔细分析，例如，某些片段的重复可能是良性的，而相同区段的缺失则可能具有临床意义。

（五）临床意义不明确V

不符合以上任何一类的V，是一个范围广泛的分类，其中一些可能在以后通过额外的证据将被证实为致病性或良性的V。

主要包括以下情况。

1.V片段大小超过实验室制定的报告阈值；

2.V在普通人群中可检出，但频率＜1%，不足以被认为是多态性；

3.V包含少量基因，但尚不清楚基因是否对剂量敏感；

4.文献或数据库对此V的分类存在争议；

5.单个基因内的V，其是否对转录阅读框有影响尚不清楚；

6.按V综合评分体系得分-0.89~0.89分。

（六）基因组病数据分析采用的数据库包括但不限于以下数据，并且拷贝数变异的分类可能因科学研究的进展或数据库更新而改变。